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                和瑞基因大Panel檢測揭示肺癌骨轉移患者更全突變信息 提升靶向治療的獲益機會

                發布時間 :2020/10/10 來源 :和瑞基因

                近日,南昌大學第二附屬醫院腫瘤科劉安文教授團隊與和瑞基因再次合作的研究成果《Genetic profiling of primary and secondary tumors from patients with lung adenocarcinoma and bone metastases reveals targeted therapy options》發表在《Molecular Medicine》(IF=4.096)雜志上。

                本研究基于和瑞基因的和全安大Panel基因檢測產品,通過同時檢測分析肺癌骨轉移患者原發灶和轉移灶腫瘤組織基因突變譜信息,輔助臨床制定個性化靶向治療方案,有助于增加患者獲益機會。
                研究背景

                肺癌是全球最常見的癌癥類型之一,絕大多數(85%)是非小細胞肺癌(NSCLC),其中肺腺癌(LA)是最常見的病理亞型。在LA患者中,最常見的轉移灶是肝、腦和骨等。患有骨轉移的患者(LABM)的預后較差,且大部分骨轉移患者生活質量大大降低。來自LA患者不同TNM階段的原發腫瘤活檢樣品的基因譜分析已鑒定出許多基因的驅動突變。多達50%的LA患者具有EGFR突變,最常見的是外顯子19缺失和錯義突變L858R,這些突變會導致酪氨酸激酶域功能亢進,進而驅動腫瘤發生。與野生型EGFR的LA患者相比,具有EGFR驅動突變的患者發生骨轉移的風險更高。對單個LABM患者原發腫瘤與轉移腫瘤組織的腫瘤遺傳突變進行更全面分析了解可以為對治療方法提供更合理的個性化診療方案。

                研究方案

                本研究對納入的17例LABM患者的原發腫瘤(PT)和繼發骨轉移(BM)進行細針穿刺活檢。研究初期使用針對EGFR和ALK融合突變的ARMS-PCR測序獲得了簡單突變圖譜,并回顧性地對原始組織與骨轉移組織使用capSMART技術檢測457個癌癥相關基因中的體細胞SNV和CNV,以獲得更詳細的基因突變概況(見圖1)。


                 

                圖1  研究路徑圖

                研究結果

                1. 基因檢測結果指導肺癌患者針對性靶向治療
                通過對PT和BM樣品進行基因檢測來明確患者突變信息(圖2), 根據腫瘤大小、腫瘤TNM分期和基因檢測結果(圖2)等信息,臨床醫師針對每位患者啟動個性化治療方案(表1)。經過3-18個月的治療隨訪,通過活檢PT和BM的大小變化評估疾病進展情況。其中(P1-P9、P12、P13)等11例在原發組織與骨轉移組織均檢出EGFR突變;對于(P10、P11)兩例患者,在原發組織未檢出EGFR突變(ARMS-PCR與capSMART技術),而在骨轉移組織利用ARMS-PCR與capSMART技術均檢出EGFR突變。對于在原發組織或骨轉移組織檢出EGFR突變患者,臨床醫師使用吉非替尼、厄洛替尼和奧西替尼等多種TKI通過單藥或聯合化療或放療進行治療。檢出ALK融合陽性的P14患者接受了TKI克唑替尼治療。對于三名EGFR / ALK陰性患者(P15、P16和P17),采用標準化療或放療方案(表1)。

                圖2  患者原發腫瘤(PT)與骨轉移組織(BM)ARMS-PCR和capSMART檢測結果。1°代表PT,2°代表BM。

                表1 患者腫瘤生物學特征及治療信息

                2. 原發組織和骨轉移組織之間體細胞變異結果分析
                17例患者均表現出獨特的變異特征,涉及SNV、插入缺失和CNV的各種組合(圖3)。14例患者(P1-P9、P12-15、P17)中,在PT和BM間有>50%的已檢測體細胞突變(包括EGFR突變)相同,且共同突變拷貝數也非常相似。表明在這些患者中,繼發BM最有可能來自PT中存在的優勢克隆。來自患者P10、P11和P17的PT和BM顯示出極少的體細胞變異,其中沒有一個是共同的遺傳變異。對于P10和P11患者,通過ARMS-PCR和capSMART檢測,僅在繼發性BM中檢出EGFR L858R突變(圖2),這可能是由于原發灶EGFR突變豐度過低或腫瘤異質性導致,并不能完全排除BM檢出的EGFR突變來自于PT的可能。以上對腫瘤組織的基因突變的大panel檢測分析明確了基因突變信息,其中部分基因突變是肺癌的可靶向治療靶點,以上表明檢測基因數目更全面及針對不同病灶組織進行檢測能夠更全面發現臨床靶向藥物使用的可能性。

                圖3  原發腫瘤組織和骨轉移組織的體細胞變異的基因突變譜

                總  結 
                本次研究發現對肺癌骨轉移患者的原發腫瘤與骨轉移組織同步進行大Panel多基因檢測能獲得更全面的基因突變信息及更多的靶藥獲益機會,可以幫助臨床醫生制定更完善的個性化靶向治療方案,將有可能改善肺癌骨轉移患者的生存狀況。

                肺癌患者經過靶向治療,不可避免會出現耐藥情況,目前有較多研究發現通過NGS無創液體活檢監測ctDNA能夠比傳統影像學等監測手段更早發現疾病進展和耐藥信息。所以患者在后續治療過程中推薦采用多基因檢測產品持續動態監控ctDNA突變信息。

                近日,和瑞基因也推出了全新的大Panel多基因檢測產品:和全安——實體瘤全靶點基因檢測(654基因),在不同指標之間找到了一個較好的平衡點,實現了“準”、“全”和“大”,詳情請見往期文章《新品上線 | 和瑞基因實體瘤全靶點基因檢測新品正式發布》。


                 

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